El Vikipedio: En la moderna epoko, la rakonto temas pri Miharu Rokujou, kiu nur volis vivi normalan vivon kaj heredi restoracion Okonomiyaki. Nuntempe lia plej granda problemo estis la konstanta ĝenado de Kouichi Aizawa kaj Durandal Thobari Kumohira, kiuj fondis Nindō (忍 道?, Klera. "Vojo de la Ŝinobo"). Miharu volis nenion fari kun "ninjas" kaj malakceptas ilin ĉiufoje. Sed baldaŭ, li estas atakita fare de fakta grupo de Ŝinoboj kaj estas protektita fare de Kouichi kaj Kumohira. Tie, Miharu ekscias pri la kaŝa ninja mondo Nabari, la roloj de sia samklasano kaj instruisto en tiu mondo, kaj pri la sekreta arto Shinra Banshou (森羅 万象 Shinrabanshō ?, lit. "ĉiuj aĵoj en naturo") ene de li. La sekreta arto, enhavanta ĉiujn mondajn sciojn, estas tre avidita en Nabari. Kaj pro tio, Miharu ne povas reveni al sia normala vivo. Li devas fariĝi la "Reganto de Nabari" por postvivi. De Baka-Ĝisdatigoj: Rokujou Miharu estis ŝajne malvolonta juniora gimnaziano loĝanta en sia propra mondo. Tamen ene de li kaŝatendis la fina potenco de Nabari, "Ĉiopova". Por posedi tian superan armilon, la Luparo de Iga ĵuris revenigi Miharu al vilaĝo Iga. Aliflanke, la angla instruisto de Miharu, Kumohira sensei, kaj samklasano Kouichi, estis la Banten-ninjas kies misio estis protekti Miharu. Milito farita pro la posedo de "Ĉiopova" tiel komenciĝis. Por postvivi, Miharu devas eniri la kaŝitan mondon Nabari, por iĝi la reĝo.
