Grandega anomalio detruis la kontinenton en Japanio kaj detruis la plej grandan parton de Tokio, mallevante tri kvaronojn de la urbo al la oceano.
Dek jarojn post, la rakonto ŝanĝiĝas al Ganta Igarashi, ŝajne averaĝa lernanto ĉe la mezlernejo de la gubernio Nagano. Kiel fuĝinto, postvivanto de la terura tertremo, Ganta vivis regulan vivon kaj ne havas memorojn pri la katastrofo. Ĉio ĉi ŝanĝiĝas kiam stranga viro kovrita per rubenkolora kiraso kaj sango flosas tra siaj fenestroj de klasĉambro. Freneze ridetante, la "Ruĝulo" masakras la tutan klason de Ganta, sed prefere mortigi lin, enigas ruĝetan kristalan breĉeton en la torso de Ganta. En malmultaj tagoj de la masakro, Ganta estas mortkondamnita en Deadman Wonderland, malliberejo kiu funkcias kiel plezurparko kaj estas submetita iu kangurujuĝejo kiel akuzito.
Alvenante en la malliberejon, Ganta estas ekipita per unika timo, kiu spuras gravajn indikilojn kaj lian lokon. Mortiga toksino estas kontinue injektita al sia sangofluo tra la kaptilo, sed tamen ĝi povas esti neŭtraligita per speciala dolĉa medikamento ĉiun tri fojojn, kiun oni ofte uzas per diversaj agoj en la malliberejo, t.e. , funkcianta malantaŭa scenejo, aĉetado per falsitaj faktoroj (speco de mono inter kaptitoj ĉe Deadman Wonderland), ktp. Por kunveni Cast Points, krimulo devas ekzekuti en la mortigaj ludoj de la instalaĵo kaj vivi. Feliĉe por Ganta, mistera virino nomata Shiro, kiu ŝajne komprenas Ganta, kaj estas komprenata de aliaj malliberuloj samtempe helpas lin.
Volante vivi kiel deliktulo sur mortpuna prizono, Ganta intencas lokalizi la "Ruĝulon" por malplenigi sian titolon. En stranga turno, Ganta komencas akiri la kapablon kontroli sian sangon, fari ĝin armilo al la ideo. Nekonata al Ganta, li fariĝis unu el la "Deadmen" de la malliberejo, izolita nombro da kaptitoj havas la Branĉojn de Peko igante ilin kapablaj kontroli sian sangon. Ganta estas igita partopreni en kruelaj gladiatorecaj mortmatĉoj nomitaj Carnival Corpse, kies anonimaj spektantoj pagas grandajn kvantojn de kontantmono por observi post kiam lia kapablo estas trovita. En lia longa batalo por vivi, li sukcesas amikiĝi kun kelkaj el tiuj, kiujn li batalis en la stadiono kaj kun ilia helpo, Ganta daŭrigas sian serĉon por malkovri la identigon de la "Ruĝa Viro", kial li ŝanĝis sin al Deadman, same kiel la ombraj sekretoj, kiujn kaŝas la malliberejaj aŭtoritatoj
